Villa Serena si trova a pochi chilometri dal centro di Bologna, ai confini del quartiere San Ruffillo, sulla strada che da Porta Santo Stefano, lungo via Murri, si giunge in via Toscana, in direzione dei Passi Futa e Raticosa.

La struttura è facilmente raggiungere per mezzo della linea di autobus, n° 96 e 13, che si fermano nelle immediate vicinanze.

Sul davanti dell’edificio è collocato il parcheggio per le auto dei visitatori. Tutt’intorno il verde costituisce una piccola oasi fresca e tranquilla nella vivace animazione dell'abitato circostante.